Khoan sử dụng một mũi khoan quay để tạo ra một lỗ hình trụ trên phôi.Mũi khoan được thiết kế để cho phép kim loại vụn (tức là phoi) tách ra khỏi phôi.Có nhiều loại mũi khoan, mỗi loại có một ứng dụng cụ thể.Các loại mũi khoan có sẵn bao gồm mũi khoan thí điểm (cho lỗ nông hoặc lỗ thí điểm), mũi khoan lỗ sâu (để giảm số lượng phoi trên phôi), mũi tuốc nơ vít (đối với lỗ không có lỗ thí điểm) và dao doa mũi khoan (để mở rộng lỗ đã tạo trước đó).
Thông thường, quy trình khoan CNC cũng sử dụng máy khoan CNC, được thiết kế đặc biệt để thực hiện các hoạt động khoan.Tuy nhiên, cũng có thể thực hiện thao tác bằng máy tiện, máy ta rô hoặc máy phay.